Шифра предмета:
1235H
Назив предмета:
Основи молекулског моделовања и хемијска информатика

Школска година:

2012/2013.

Услови похађања:

1201A + 1202A

ЕСПБ:

8

Врста студија:

основне академске студије

Студијски програм:

Хемија: 4. година, зимски семестар, изборни (1IP4H), научно-стручни предмет

Наставник:

др Марио В. Златовић
редовни професор, Хемијски факултет, Студентски трг 12-16, Београд

Сарадници:

Фонд часова:

Недељно: четири часа предавања + четири часа лабораторијских вежби (4+0+4)

Циљеви:

Овај курс oбрађује најновије области и рачунарске алатe у медицинскоj хемији, биоинформатици и хеминформатици.

Исход:

По завршетку овог курса студенти треба да буду оспособљени за рад у оквиру савремених истраживачких тимова у области медицинске хемије, хемије протеина, нанотехнологије итд, и спремни да на основу стеченог знања доносе компетентне одлуке о токовима истраживања. У оквиру вежби полазници курса ће се упознати и савладати основне модуле програмског пакета Schrödinger Suite 2012 (Schrödinger, LLC, 2012, http://www.schrodinger.com/)

Облици наставе:

Предавања, теоријскe вежбе, семинарски рад(ови).

Ваннаставне активности:

Литература:

Основна литература:

  • Höltje, Sippl, Rognan, Folkers: Molecular Modeling: basic principles and applications, Wiley-VCH, 2003.

Помоћна литература:

  • Текући радови и додатни материјал, упутства и примери из пакета Schrödinger Suite 2012 (Schrödinger, LLC, 2012, http://www.schrodinger.com/)

Додатни материјал:

  Наставне обавезе и начин оцењивања

Предавања:

5 поена (4 часа недељно)

Програм рада:

Молекулско моделовање, структура и моделовање протеина, дизајн лекова на основу структуре, дизајн лекова на основу фармакофорног модела, QSAR, синтеза и дизајн библиотека, пептидомиметика, АДМЕ особине и предвиђања, хеминформатика, опште теме.

Лабораторијске вежбе:

10 поена (4 часа недељно)

Програм рада:

Геометрија молекула и стереохемија, 3Д анализа, структура и моделовање протеина, принципи рационалног дизајна лекова, дизајн лекова на основу структуре, дизајн лекова на основу фармакофорног модела, QSAR, синтеза и дизајн библиотека, пептидомиметика, АДМЕ особине и предвиђања, 3Д претрага база података, развох физиолошки активних једињења.

Семинарски радови:

15 поена

Колоквијуми:

20 поена

Домаћи задаци:

10 поена

Писмени испит:

40 поена